依据各种交通运输方式的特点，根据不同的运输情况选择合适的运输方式．公路运输机动灵活、可以从门口到门口，价格适中，适合短距离运输；航空运输速度快、但是运量小，价格高，适合急需情况的长途运输；铁路运输速度较快、运量较大，运价适中，适合运量较大的长途运输；水上运输运量大、运价低，但是速度慢、受地域的限制，适合两海港之间较大运量的长途运输；管道运输在地下，一般适合长距离输送石油、天然气、水．
【解析】
南京和长江三峡都位于长江沿岸，有一批机器要从南京运往长江三峡，最经济和便利的运输方式是水路运输．
故选：B．
