A、乌鲁木齐位于新疆，兰新铁路与北疆铁路相交于该城市，该城市是铁路枢纽，不是水运枢纽；
B、武汉位于长江中游，南北向的京广铁路经过该城市，该城市既是铁路枢纽，又是水运枢纽；
C、济南位于京沪铁路线上，铁路交通便利，但水运不便利；
D、北京是我国最大的铁路交通枢纽，但该城市水运不便利．
【解析】
A、乌鲁木齐位于新疆维吾尔自治区，兰新铁路与北疆铁路相交于该城市，该城市是铁路枢纽，不是水运枢纽，不符合题意；
B、武汉位于长江中游，南北向的京广铁路经过该城市，该城市既是铁路枢纽，又是水运枢纽，符合题意；
C、济南位于京沪铁路线上，铁路交通便利，但水运不便利，不符合题意；
D、北京是我国最大的铁路交通枢纽，但该城市水运不便利，不符合题意．
故选：B．
