A、根据分子是保持物质化学性质的最小微粒；原子是化学变化中的最小粒子，进行解答；
B、分子和原子的根本区别是：在化学反应中，分子可以分成原子，原子不能再分；进行解答；
C、分子原子的运动速率比较，须在同种条件下，分子无法比较；
D、根据由同种元素可以构成不同的物质：比如说金刚石和石墨，氧和臭氧，水和重水，氢和氘等都是由同种元构成，进行解答．
【解析】
A、根据分子是保持物质化学性质的最小微粒；原子是化学变化中的最小粒子，保持水的化学性质的粒子是水分子；故A说法错误；
B、分子和原子的根本区别是：在化学反应中，分子可以分成原子，原子不能再分；故B说法正确；；
C、分子原子的运动速率比较，须在同种条件下，分子无法比较；故C说法错误；
D、根据由同种元素可以构成不同的物质：比如说金刚石和石墨，氧和臭氧，水和重水，氢和氘等都是由同种元构成；故D说法错误；
故选B．
