物理性质是指物质不需要发生化学变化就表现出来的性质．化学性质是指物质在化学变化中表现出来的性质．而化学变化的本质特征是变化中有新物质生成，因此，判断物理性质还是化学性质的关键就是看表现物质的性质时是否有新物质产生．
【解析】
A、生铁和钢的性质不同，是由于含碳量不同，说法正确，故A正确；
B、CO和CO2的性质不同，是由于构成它们的分子不同，说法正确，故B正确；
C、刚石和石墨的物理性质不同，由于构成它们的碳原子不同，说法错误，是由于其碳原子排列组成不同，故C错误；
D、金属钠和镁的性质不同，是由于钠和镁的原子结构不同，说法正确，故D正确．
故选C．
