由甲分子与乙分子反应生成丙分子的示意图，1个甲物质的分子与3个乙分子发生反应，生成2个丙物质的分子；其中甲物质分子由2个B原子构成的单质分子，丙物质的分子由3个A原子与1个B原子构成的化合物的分子．
【解析】
A、物质甲的分子由2个B原子构成，属于同种原子构成的单质分子，即物质甲为单质；故A正确；
B、反应生成2个丙物质的分子，每个分子由1个B原子和3个A原子构成，所以丙分子中A、B原子个数比为3：1；故B正确；
C、反应生成2个丙物质的分子，共含有2个B原子和6个A原子，而反应前的1个甲物质的分子中只含有2个B原子，根据化学变化前后原子种类、个数不变，可知每个乙物质的分子则2个A原子构成，所以乙物质的化学式为A2；故C正确；
D、反应前后A、B两种原子的个数分别为6、2，因此反应前后原子个数不变；而反应前共有4个分子参加反应，反应后生成了2个分子，反应前后分子个数发生改变；故D不正确．
故选D．
