根据元素的概念可以知道同种元素的质子数相等，但质子数相等的粒子不一定为同种元素；质量数是将原子内所有质子和中子的相对质量取近似整数值相加而得到的数值，近似的相对原子质量也能用质子数+中子数的和来计算但不是它们不是等价的；可以据此分析并完成解答．
【解析】
①质子数相同的粒子一定是同种元素，例如CH4和NH3中都含有10个质子，但它们不是同种元素；故错误；
②元素的原子的最外层电子数决定了元素性质，而同位素的外层电子数相等，所以它们的化学性质几乎完全相同，但物理性质不一定相同，故错；
③两种粒子的质子数、电子数都相等，它们可能是两种不同分子，如NH3和H2O分子，质子数与核外电子数均为10，同理两种粒子的质子数相等，原子得失电子形成离子，同种元素的原子和离子核外电子数不同，故不可能是同一种离子；故质子数相同，电子数也相同的两种粒子，不可能是一种分子和一种离子，故对；
④NH3和H2O分子，质子数与核外电子数均为10，但它们不是同种元素，故电子数相同的粒子不一定是同一种元素，故对；
⑤根据同位素的概念可以知道，一种元素中可能含有多种原子，而不同的原子之间中子数不同，所以一种元素可能有多种质量数，故错；
⑥质量数是将原子内所有质子和中子的相对质量取近似整数值相加而得到的数值，近似的相对原子质量也能用质子数+中子数的和来计算但不是它们不是等价的，故错．
根据上述分析可以知道叙述正确的是：①②⑤⑥．
故选C．
