此题考查的是萌发的种子进行呼吸作用消耗氧气．蜡烛的燃烧需要氧气，萌发的种子通过呼吸作用将瓶内的氧气消耗尽了，因此将燃烧的蜡烛放入盛有萌发种子的瓶子里，蜡烛会熄灭．
【解析】
呼吸作用是指细胞利用氧，将有机物分解成二氧化碳和水，并且将储存在有机物中的能量释放出来，供给生命活动的需要的过程．萌发的种子呼吸作用旺盛．吸收瓶内的氧气，释放出大量的二氧化碳；因此将燃烧的蜡烛放入装有正在萌发的种子的瓶子里，蜡烛熄灭，其原因是该瓶内萌发的种子进行呼吸作用，把玻璃瓶中的氧气消耗尽了．选项B、C不符合题意，选项D是错误的．
故选：A．
