本题主要考查染色体，DNA和基因的关系，DNA在染色体上，DNA上有基因．
【解析】
（1）生物的主要遗传物质是DNA．一条DNA分子上有许许多多的基因，一个基因只是DNA上的一个片段，生物的各种性状都是分别由这些不同的基因控制的．可以说：基因是染色体上具有控制生物性状的DNA片段．
（2）染色体由DNA和蛋白质组成，DNA上有数万个基因．
（3）DNA是染色体的主要化学成分，同时也是组成基因的材料．有时被称为“遗传微粒”，因为在繁殖过程中，父代把它们自己DNA的一部分复制传递到子代中，从而完成性状的传递．
故答案为：蛋白质；DNA；DNA
