此题考查的是细菌、真菌在自然界中的作用以及与人类生活的关系,大部分细菌是有益的,有的细菌是有害的,据此答题.
【解析】
A、在豆科植物的根瘤中,有能够固氮的根瘤菌与植物共生,根瘤菌将空气中的氮转化为植物能够吸收的含氮物质,从而使得植物生长良好,而植物则为根瘤菌提供有机物,它们互惠互利,共同生活.甲烷菌能分解污水中的有机物,产生甲烷,甲烷是一种清洁的能源,还起到净化污水的作用,不符合题意.
B、有些细菌等微生物的发酵在食品的制作中有重要作用,如制醋要用到醋酸杆菌、制泡菜和酸奶要用到乳酸杆菌.不符合题意.
C、软腐病细菌能引起白菜等多种蔬菜发生软腐病,肺炎双球菌能使人患肺炎,可见都是有害菌.符合题意.
D、大肠杆菌是人和许多动物肠道中最主要且数量最多的一种细菌,一般不致病,但一些特殊血清型的大肠杆菌对人和动物有病原性,尤其对婴儿和幼畜(禽),常引起严重腹泻和败血症.人们在大肠杆菌中转入合成胰岛素的基因,可以生产人们需要的胰岛素,这是对其的利用方面.金色葡萄球菌是人类的一种重要病原菌,隶属于葡萄球菌属,可引起多种严重感染,有“嗜肉菌“的别称.
故选:C