此题考查细胞核、染色体、DNA和基因之间的关系．基因位于DNA上，DNA位于染色体上，染色体存在于细胞核中．
【解析】
细胞的控制中心是细胞核，细胞核中能被碱性染料染成深色的物质称做染色体，它是由DNA和蛋白质两种物质组成的，DNA是主要的遗传物质，呈双螺旋结构，在体细胞内染色体是成对存在的，每条染色体包含一个DNA分子，DNA分子也是成对的，每个DNA分子上有许多基因，基因是具有特定遗传信息的DNA片段．即：基因位于DNA上，DNA位于染色体上，染色体存在于细胞核中．可见，选项D符合题意．
故选：D．
