生物的遗传物质改变的原因有：基因重组，基因突变和染色体变异等，生物的基因有显性和隐形之分，据此可以解答本题．
【解析】
A、把萌发的种子拿到太空去经过射线辐射，再回地面种植而后长出新品种，是使植物细胞体内基因发生突变的结果，属于基因突变．
B、北方栽培的又香又甜的苹果移栽到广东后，其苹果变得又酸又涩属于地区差异，由于水质、土壤、光照、温度等条件引起，与基因无关．
C、高茎豌豆与矮茎豌豆杂交属于基因自由组合，并不能使基因结构发生改变．
D、一对表现正常的表兄妹近亲结婚属于基因自由组合，由于他们的外祖父是白化病患者，他们可能是隐形白化病的携带者，所以生了一个白化病和色盲的儿子，不符合题意．
故选：A
