此题是一道实验探究题，考查的是在生态系统中的各生态因素作用．
【解析】
动物无论什么环境中都是指进行呼吸作用，消耗氧气；绿色植物在有光的环境中同时进行光合作用和呼吸作用，为所处的环境增加氧气，在黑暗环境中只进行呼吸作用消耗氧气．在四个密闭的玻璃瓶中，哪个瓶中的氧气耗尽的最早，哪个瓶中生物的生存时间最短．
A、密闭的玻璃瓶，只有两条小鱼，瓶中的氧气耗尽的不会是最早的，故不合题意．
B、密闭的玻璃瓶，虽然有两条小鱼和一些水藻，但是在光的环境中水藻还能进行光合作用释放氧气，所以它们存活的时间应该很长．故不合题意．
C、密闭的玻璃瓶，只有两条小鱼，瓶中的氧气耗尽的不会是最早的，故不合题意．
D、密闭的玻璃瓶，虽然也是有两条小鱼和一些水藻，但是在黑暗环境中小鱼和水藻都进行呼吸作用消耗氧气，所以该瓶内的氧气是被耗尽最早的，瓶中生物的生存时间最短．故符合题意．
故选：D．
