根据具有消化功能的器官有口腔、胃、小肠，口腔只能初步消化少部分淀粉，胃能消化少部分蛋白质，小肠中含有多种酶，可以消化淀粉、蛋白质、脂肪等．
【解析】
消化道中有消化功能的器官有口腔、胃、小肠，口腔中有唾液，唾液中含有唾液淀粉酶，可以初步消化少部分淀粉，胃中有胃液，胃液中含有胃蛋白酶，能初步消化少量的蛋白质，小肠中有胆汁、胰液、肠液等可以消化淀粉、脂肪、蛋白质等营养物质，故小肠是消化的主要器官；
有吸收功能的器官有胃、小肠、大肠，胃只能吸收少量的水、无机盐和酒精，大肠能吸收少量的水、无机盐和部分维生素，而小肠可以吸收水、维生素、无机盐、葡萄糖、氨基酸、甘油、脂肪酸等，是吸收的主要器官；因此小明在早上吃了一个鸡蛋，一个面包和一杯牛奶，这些物质主要在小肠里被消化吸收的．
故选C
