根据二次函数的图象与x轴的交点为(-1,0),(3,0)可求出抛物线的对称轴,再根据二次函数的性质对各选项进行逐一判断即可.
【解析】
∵二次函数的图象与x轴的交点为(-1,0),(3,0),
∴抛物线的对称轴直线为:x==1,故A正确;
∵抛物线开口向下,对称轴为x=1,
∴当x>1时,y随x的增大而减小,故B正确;
∵二次函数的图象与x轴的交点为(-1,0),(3,0),
∴一元二次方程ax2+bx+c=0的两个根是-1,3,故C正确;
∵当-1<x<3时,抛物线在x轴的上方,
∴当-1<x<3时,y>0,故D错误.
故选D.