根据题意,先设EC与AF交与点O,过点O作OG⊥面ABCD,垂足为G;由图分析可得,四棱锥E-ABCD与四棱锥F-ABCD公共部分为四棱锥O-ABCD;根据线面垂直的性质和平面的基本性质,可得CF、OG、AE两两平行且共面;进而在平面FCAE中,计算可得OG的值,依题意,易得底面菱形ABCD的面积,由棱锥体积公式,计算可得答案.
【解析】
根据题意,设EC与AF交与点O,过点O作OG⊥面ABCD,垂足为G;
分析可得,四棱锥E-ABCD与四棱锥F-ABCD公共部分为四棱锥O-ABCD;
依题意,AE,CF都与平面ABCD垂直,OG⊥面ABCD,
可得CF、OG、AE两两平行且共面;
又由AE=2,CF=4,
由平行线的性质,可得OG=,
菱形中,对角线AC=4,,可得其面积S=24=4,
故其体积为4=;
故选A.