由题设知四棱锥P-ABCD中,PA⊥面ABCD,ABCD是边长为a的正方形,PA=a,由此能求出在四棱锥P-ABCD的任意两个顶点的连线中,互相垂直的异面直线有多少对.
【解析】
∵四棱锥P-ABCD的顶点P在底面ABCD上的投影恰好是A,
其正视图与侧视图都是腰长为a的等腰直角三角形,
∴四棱锥P-ABCD中,PA⊥面ABCD,ABCD是边长为a的正方形,PA=a,(如图)
∴在四棱锥P-ABCD的任意两个顶点的连线中,互相垂直的异面直线有:
PA和AB,PA和AD,AB和AD,AB和BC,ABC和DC,DC和BC,共6对.
故答案为:6.