A、农家肥和化肥各具优点综合施用，既提高生产效益也有利于水土保护；
B、二氧化碳是植物光合作用必不可少的原料；
C、种植、养殖、制沼气相结合是社会主义新农村建设的新模式，在改善农村卫生状况的同时也可以很好地对资源进行整合利用；
D、铵态氮肥和碱性物质混合会发生反应而降低肥效．
【解析】
A、农家肥所含营养成分多含量少，也化肥营养成分较单一但含量高，二者混合使用可以提高效益．故做法妥当；
B、在大棚中加入适量的二氧化碳可以促进植物的光合作用，从而提高产量．故做法妥当；
C、种植、养殖、制沼气相结合，既可改善农村的环境卫生，也有利于资源的整合利用．进而提高农业产量．故做法妥当；
D、硝酸铵和熟石灰混合时二者会发生化学反应生成具有挥发性的氨气而降低肥效．故做法不妥当．
故选D．
