根据题意,新得到的几何体有12个顶点,由组合数公式可得从中任取两点连成直线段的情况数目,再分析其中直线段位于正方体内部的情况:用间接法,新几何体在原正方体的一个侧面上有4个点,从中任取两点连成直线段直线段不在原正方体的内部,由组合数可得其条数,进而可得所有不在正方体的内部的直线段的条数,进而可得在正方体的内部的直线段的条数;由等可能事件的概率计算可得答案.
【解析】
根据题意,新得到的几何体有12个顶点,从中任取两点连成直线段,共有C122=66种情况,
其中原正方体的一个侧面上有4个点,从中任取两点连成直线段,有C42种情况,这些直线段不在原正方体的内部,
正方体共6个面,则不在原正方体的内部,即在其表面的有6×C42=36种情况;
则在正方体的内部的有66-36=30条;
则概率为=;
故选B.